În corespundere cu art. 51 lit. h) din Legea nr. 1104/2002 cu privire la Centrul Naţional Anticorupţie, Centrul are atribuția de efectuare a evaluării integrității instituționale în condițiile Legii nr. 325/2013 privind evaluarea integrității instituționale. Potrivit Legii nr.325/2013 privind evaluarea integrităţii instituționale, evaluarea integrităţii instituționale reprezintă un proces de identificare a riscurilor de corupţie în cadrul entității publice cu ajutorul metodelor analitice şi practice (testarea integrităţii profesionale), de descriere a factorilor care determină riscurile identificate şi consecințele acestora, precum şi de oferire a recomandărilor pentru diminuarea lor, desfășurat în conformitate cu prevederile prezentei legi.
Evaluarea integrităţii instituționale se inițiază de către Centrul Naţional Anticorupţie în privinta tuturor entităților publice care intră sub incidența Legii nr.325/2013 şi se finalizează cu elaborarea raportului privind rezultatele evaluării integrităţii instituționale care se prezintă entităților evaluate şi se publică pe pagina web a Centrului.